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痰培养甲基表达水平与早期肺癌的研究
定义一个基因启动子甲基化签名痰液中肺癌风险评估
ShuguangLeng,KieuDo,[...],andStevenA.Belinsky
目的
为了评估的31个基因在痰液中从科罗拉多州的队列扩展嵌套,病例对照研究和评估结果,从最有前途的基因在无症状的I期肺癌的独立病例对照研究复制的生物标志物的甲基化状态患者从新墨西哥。
实验设计
来自科罗拉多州和新墨西哥州的病例和对照审问中使用嵌套,甲基化特异性PCR检测多达31个基因的甲基化。
单个基因和甲基化指数被用来评估与logistic回归模型的甲基化与肺癌之间的关联。
结果
十七个基因的1.4比值比-3.6被确定,并在新墨西哥州的研究选择了复制。
总体而言,出现在新墨西哥州的影响方向是相似的科罗拉多州,在歧视情况下的最大增幅(比值比,3.2-4.2)看到的PAX5α,GATA5和SULF2基因。
来自科罗拉多州和新墨西哥州的研究7基因电池板产生ROC曲线显示,71%和77%的预测准确度分别。
一个22倍的肺癌风险被视为新墨西哥州情况下有五个或更多的基因甲基化的一个子集。
与肺癌相关的序列变体并没有提高该基因的甲基化面板的准确性。
结论
这些研究已经确定和复制的基因甲基化的面板,其整合其他有前途的生物标志物可以初步确定最高风险吸烟者计算机断层扫描筛查早期发现肺癌。
关键词:
基因甲基化,痰,肺癌,生物标志物
介绍
肺癌仍然是癌症相关死亡的,在美国的首要原因低成本,非侵入性的筛选方法来确定吸烟者风险最高的肺癌的制定和实施是一种方法,可以减少与此疾病相关的死亡率。
生成了来自全国肺癌筛查试验(NLST)报道的死亡率降低20%,肺癌低剂量计算机断层扫描(CT)筛选标准相比,胸部X光发现相当兴奋
(1)。
然而在CT筛查的参与者39%至少有一个正的筛选结果与这些结果>96%最终被归类为假阳性。
这代表了94%,61%,特异性和6%,比三年期筛查阳性预测值的敏感性。
此外,对于55放映的资格要求-捕获当前被诊断七十四岁与30包年最低吸烟史的肺癌约30%
(1)。
加审问访问的生物流体,如痰和血液分子生物标志物可以识别吸烟者的风险最高为肺癌,并通过减少假阳性结果增强CT筛查。
我们集团一直专注于开发基因启动子甲基化检测痰液中作为分子标记用于识别高危人群癌症发病率
(2)。
通过基因相邻的胞嘧啶甲基化沉默的CpG岛,以鸟苷与染色质重塑一起导致基因启动子区,它拒绝访问所需的转录(调节蛋白的异染色质的发展3)。
这种表观遗传学驱动的过程是一个重大的和因果事件沉默数百个基因的肺癌发生和发展过程中参与正常细胞功能的各个方面。
重要的是,基因如沉默CDKN2A(P16),Ø 6 -甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)和腺瘤性息肉病(APC)在肺泡和吸烟者的支气管上皮细胞被检测到,在癌前病变到癌和鳞状细胞癌,以及在疾病进展基因甲基化的增加的患病(4,5)。
在上皮细胞和癌前病变的吸烟者的肺表观遗传学改变这些调查结果反映了证据充分的领域癌变存在于整个呼吸消化道也提出了“危险”人群的障碍来自大区分早期肺癌(6)。
基于对吸烟者的肺部关键的肿瘤抑制基因的沉默,我们推测在脱落的上皮细胞痰基因启动子甲基化的检测将提供现场癌变的程度进行评估,反过来可以预测早期肺癌。
甲基化的发展特异性PCR(MSP)和随后的嵌套的MSP能够检测在包括蜂窝内容的一小部分(<3%)存在于来自肺癌患者的痰液脱落的上皮细胞中的基因的启动子的甲基化所需要的灵敏性和特异性和无癌症的吸烟者(7,8)。
在概念验证的一个小研究中,甲基化p16基因或MGMT基因启动子检测长达3年的鳞状细胞癌的诊断之前,(8)。
这一发现使我们对事件进行肺癌病例的巢式病例对照研究,从一个非常高风险人群(科罗拉多州学年)评估是否基因的面板可以甲基化的痰液中所预测的肺癌被发现。
从该研究的主要发现包括在痰液检测的时候肺癌诊断基因启动子甲基化的增加患病率下降,而614基因与>50%肺癌风险增加相关(9)。
重要的是具有三甲基化的这些6个基因或多个用64%的灵敏度和特异性相关。
这些研究结果支持基因启动子甲基化的承诺作为一种分子标记分层肺癌的风险,同时也强调需要通过评估在肺肿瘤启动子甲基化通常沉默,以提高该基因面板的灵敏度和特异性的其他基因。
本研究的目的是评估23个候选基因,以及来自我们先前的研究(最有前途的八个基因9)在从科罗拉多队列扩展嵌套,病例对照研究,并从最有前途的评估结果的复制基因的无症状阶段的肺癌患者从新墨西哥州(NM)的独立队列研究。
此外,我们确定从基因分型序列整合结果变体通过全基因组关联研究中发现,为与肺癌的风险会提高一个精致的基因甲基化面板的灵敏度和特异性。
材料和方法
研究人群
研究人群测试和复制的甲基化生物标志物是由CO和NM分别。
所有参与者均签署的IRB批准的知情同意书和研究。
科罗拉多州的参与者来自科罗拉多州癌症中心痰液筛查队列研究,于1993年发起,以确定痰内发现生物标志物是否可以预测未来的肺癌发展的前瞻性研究大学中选择。
在研究的方法先前已(描述9,10)。
简单地说,对象为社区和学术肺诊所招募主要是在科罗拉多州丹佛大都会区。
在招生,学科分别为25岁或以上的≥30包年的吸烟史,并与肺气流梗阻的用力呼气容积1秒肺活量测定结果的75%或低于预测的(FEV1)记录年龄,性别和身高;和≤0.75的FVC比值。
参加者提供了两个容器装满2%聚乙二醇和50%的酒精(Saccomanno的固定液)的固定液,并指示一个清晨,自发的咳嗽痰标本,连续6天(3天收集收集到的第一个容器中,三日的收集到第二个容器)。
从第二个3天的汇集痰样品材料进行采样用于本研究(11)。
由于大多数参与者贡献少于2份痰标本在这项前瞻性队列研究,入选研究的情况下,是那些谁18个月内提供的痰标本之前的癌症诊断。
根据我们先前的研究可表明基因启动子甲基化的发生率增加,此期限内采集的样品相比,>18个月这段时间内被选中。
共有64个案例,符合这些标准,他们被按性别,年龄和月份入学的匹配对照组(n=64)。
新墨西哥州病例和对照的肺癌队列和洛夫莱斯吸烟者队列(LSC)入选,分别。
新墨西哥肺癌队列成立于2005年报名参加,并按照新诊断的肺癌患者,不论肿瘤分期和组织学的。
肺癌患者经过多学科胸肺科诊所在新墨西哥大学被招募。
肿瘤分期和组织学是通过临床表现和病理定义。
这项研究仅限于第一阶段的肺癌病例是一般无症状疾病,并进行“治疗”肿瘤切除术。
例为当前或既往吸烟者45-75岁高龄,能够提供痰标本。
自发痰收集在入学时(约1-前2周至手术)在家中所描述的科罗拉多队列早晨。
在这项研究时,328例肺癌患者曾入读的队列和90带有第一阶段的疾病。
四五这些科目产生痰和五个被排除因年龄导致40样本大小。
整体约65%,肺癌病例与吸烟的LSC的70%产生足够的细胞学痰,分别由肯尼迪的定义等。
(11)。
控制是癌症的吸烟者参加到LSC,以确定危险因素的基因甲基化(12,13)。
招生,这是仍在进行中,仅限于当前和前吸烟者年龄40到75是用最少的15包年的吸烟。
参加者主要是新墨西哥州大都市区的居民,并提供痰和血,并进行标准的肺功能测试。
对照组(n=90)的频率相匹配的情况下(〜2:
1)年龄(5年为间隔)和性别。
痰处理和甲基化特异性PCR
我们在原来的研究,在Saccomanno的固定液CO痰标本的长期储存(>3年)可导致DNA降解遵守和执行一个协议,用于NM涉及洗痰标本,减少粘液,其次是冷冻的标本在6个月采集的范围内的颗粒在-80℃下。
由CO痰样本在18个月诊断收集,虽然确认的情况下,状态往往需要数年后样品的采集。
DNA从痰由蛋白酶消化,然后用酚氯仿抽提,乙醇沉淀分离出来。
样品标记只与特定的研究编码标识符的情况下或控制状态盲目调查。
试验进行了与病例和对照包括在每个批次。
二十三个新的基因(见结果),选择用于评估基于他们的肺肿瘤发生率(≥25%),功能的多样性,以及在已知的肺癌的发展过程中失活的时间,研究了在CO病例组和对照(4,5 14 - 17)。
此外,与肺癌风险增加有关的前八个基因(P16,MGMT,DAPK,RASSF1A,GATA4,GATA5,PAX5α和PAX5β)从我们以前的研究也进行了评估(9)。
我们的嵌套,MSP法检测使用,因为检测痰液中启动子甲基化的敏感性增加。
简言之,该方法涉及的DNA(亚硫酸氢盐修饰9),随后加入1阶段的PCR同时扩增4基因启动子区域。
第一阶段的引物识别亚硫酸氢盐修饰的模板,但不要甲基化和未甲基化的等位基因之间的区别。
第1阶段的PCR产物(5微升1:
50稀释的第1阶段的),然后进行第2阶段的PCR中的引物特异性的甲基化的模板使用。
所有第2阶段的PCR反应在退火温度下(68-70℃)超过引物的熔化温度下进行,以确保最高的特异性针对所存在的DNA样品中只有甲基化等位基因的扩增。
为了准确地在所有的人标本1的灵敏度比的甲基化的发生率10-20000,以下修改与亚硫酸氢盐被用于第1阶段的PCR100-150纳克的DNA。
在甲基化特异性引物进行第2阶段的每个基因的启动子是位于周围的转录起始位点,其中甲基化密切相关的基因沉默和描绘(表S1)的12个基因向前行驶的前瞻性研究。
痰是包含炎症,上皮和口腔细胞的一个非常庞杂的标本。
上皮馏分通常包括<痰样品的3%。
这相当细胞的异质性,其中跨越不同学科,限制了由此定量甲基化的能力,甲基化记录为正或负。
由于随机抽样的问题(详见[讨论9,其中含有被甲基化的基因的上皮分数通常是<痰样品的3%,测定是在重复进行的起始的DNA的亚硫酸氢盐修饰])。
检测在任一检测基因甲基化被记为一个积极的针对该特定基因的甲基化(9)。
定量MSP是用来评估甲基化水平的基因在新墨西哥州情况下的一个子集和控制,以证实或驳斥我们的战略进行甲基化的痰非定量评估。
基因甲基化水平由标准QMSP量化,有和没有一个嵌套的放大了我们的商业合作者MDxHealth,正式ONCOMETHYLOME科学。
甲基化截断由接收器特性运算符(ROC)曲线(设置18)。
SNP基因分型
(从染色体15q25,5P15和6p21的五个SNP位点在全基因组关联研究,以确定与肺癌相关的被利用TaqMan等位基因鉴别检测基因分型中的两个同伙病例和对照19 - 23)。
基因组DNA的痰标本和外周血淋巴细胞的恢复被用于基因分型在科罗拉多州和新墨西哥州的同伙,分别。
从新墨西哥州患者的一个子集痰标本和外周血淋巴细胞中测得的基因型表现出100%的协议。
样品的百分之十重复和100%的一致性被认为对于结果从最初的基因分型。
此外,包括已知的基因型为每个SNP样品均包括在每批96个样品,以指导正确的集群。
数据分析
人口,甲基化和基因变量进行了总结与百分比为分类变量的均值和标准差为连续变量的情况下,控制状态。
在病例组和对照组之间人口统计学变量的差异进行了评估与费舍尔的分类变量的精确检验和Wilcoxon秩和检验,连续变量。
甲基化和基因变量和病例对照状态之间的关联被表示为从逻辑回归模型为设计变量(年龄和性别)以及其它重要的协变量包括吸烟状况和包获得与调整的比值比及其相应的95%置信区间吸烟年限。
年龄和包年被输入为连续变量。
包-年吸烟被定义为包每天乘以吸烟年数熏制的平均数目。
前吸烟者定义为那些谁已经戒烟一年以上在问卷完成时间的人。
无论是个人基因和甲基化指数被用来研究甲基化与肺癌之间的关联。
所有的基因被单独评估,以调整上面列出的协变量。
慢性阻塞性肺病是不包括在logistic回归模型对CO,因为所有的受试者有慢性阻塞性肺病。
关于NM,有对的情况下,30%的失踪肺功能的效果,从而COPD是不包括在模型中,因为样本大小将已显著降低。
对基因的子集,甲基化的基因的多重性被定义为基因的甲基化基因的面板的数量。
所得到的甲基化指数也被用作在逻辑回归模型的独立变量。
受试者工作分类曲线被用来评估这些模型,并确定最佳的基因甲基化面板。
甲基化指数和组织学类型肺癌之间的关系中每个队列内的情况进行了评估。
此外,甲基化指数和分阶段性肺癌(IA与IB)之间的关联也被中网管情况进行评估。
统计显着性为p值来表示。
所有分析均进行了使用统计分析软件(SAS,9.2版,SAS软件研究所,公司,凯里,北卡罗来纳州)。
结果
接触史和病理
从CO和NM病例组和对照关键人口统计变量总结在表1。
在科罗拉多州的队列成员反映至少30与15包年的CO和新墨西哥州的参与者,分别入学标准的吸烟史有关包年为高。
鳞状细胞癌和非鳞状细胞肺癌(包括腺癌,大细胞癌和未指定的)的发生率相似科罗拉多州之间的案件。
与此相反,癌症确诊病例新墨西哥州68%属非鳞状肺癌。
所有病例从海里为第一阶段与IA和IB的平等分配,而病期为科罗拉多情况下不可用。
表1
所选变量的情况下,通过控制状态摘要
痰液中甲基化的基因与肺癌风险相关的鉴定
23个新基因和8个基因的基因甲基化状态(P16,MGMT,DAPK,RASSF1A,GATA4,GATA5,PAX5α,PAX5β)最初证明甲基化的情况下,与对照组相比从调查有限公司痰标本进行了评估增加的可能性被蒙蔽35个样本开始样品被DNA用量最大的是可利用-以案的情况和分析是在30个批次进行。
由于DNA的量限制了一些样品,中期分析进行后大约三分之二的病例和对照进行了检测。
十四个基因的甲基化0的患病率-痰70%,表现出的情况下(没有甲基化增加的可能性表S2)。
相对于对照组(例3.6-对于剩下的17个基因在所有科目进行分析,赔率分别提高1.4 表2)。
显著或边缘显著(P<0.05-0.1)的比值比,看到的五个基因,其中包括PAX5β,DAL1,PCDH20,KIF1A和DCR2(表2)。
表2
患病率和来自科罗拉多州和新墨西哥州的病例对照研究痰标本中奇数比对基因启动子甲基化
这17个基因在新墨西哥州病例和对照选择复制。
Ⅰ期肺癌患者进行了研究,因为这类患者是无症状的疾病,早期发现与治疗目的切除相结合是最有可能提高生存率。
有一个增加的在海里标本检测甲基化可能反映痰分离出的DNA的质量较好保存在-80°C的能力 这是通过对从NM的第1阶段的PCR产物强度的提高一致性相比CO。
总体而言,看到在NM队列对于大多数基因是相似,看到与CO的异常的影响的方向明显TCF21,DCR2,DAB2和GATA4这表明很少病例和对照组之间没有差异。
在新墨西哥州和CO同伙之间观察到的情况下歧视增幅最大的PAX5α,GATA5和SULF2基因,表现出3.2-1.8倍,CO(-相比于1.4NM4.2倍的比值比见表2)。
总体而言,NM科目,显著的差异,看到的PAX5α,GATA5,DAL1和SULF2(P<0.05)和临界意义DAPK和PAX5β(P≤0.07)。
最后,两个基因的甲基化状态,CXCL12和CXCL14通过全基因组转录谱(发现的24)与功能的31个基因以上研究不同的是在NM病例和对照评价(DNA从许多二氧化碳的样品耗尽)。
甲基化CXCL14,但不CXCL12显著与肺癌(OR=6.3,P<0.004;相关表2),证实原来的研究表明该基因可能是肺癌的检测(一种潜在的生物标志物24)。
整体基因甲基化出现在任何人群的关联不是具体的组织学类型的肺癌或舞台IA和IB患者在海里之间的不同(未显示)。
定量MSP(QMSP)是来自新墨西哥州的样品进行,以确定是否在痰定量甲基化会更好地控制区分案件。
甲基化P16,DAPK,GATA4和GATA5被使用嵌套QMSP和标准QMSP评估。
使用甲基化截断这两种方法来提高病例组和对照(未显示)进行分类的能力,这一发现与事实的痰标本是一个可变的上皮成分高度异质性是一致的。
此外,没有任何理由怀疑一个小肺癌(<1厘米),周围型肺癌将直接有助于足够的肿瘤细胞成痰标本,产生甲基化等位基因的数量差异水平显著提高。
基因甲基化的面板与肺癌风险协会
从CO和NM同伙被生成的受试者工作曲线的分类,以确定如何以及不同的基因面板的甲基化区分肺癌病例与对照。
最初的11个基因(P16,MGMT,DAPK,PAX5α,PAX5β,GATA5,德尔-1,PCDH20,JPH3,KIF1A和SULF2)由共同的OR值最高的两个研究组之间进行了评价;CXCL14被列入海里。
ROC曲线表明,基因甲基化增加了所得到的分类精度只有协变量从62%至69%的CO(P<0.08)和NM58%至73%(P<0.01)(图1)。
的范围内的11多种基因的甲基化-和12-基因的面板是高度相关的痰,因此我们评估了7基因面板,提供病例和对照之间的最区别的性能。
这些小组由MGMT,DAPK,PAX5β,德尔-1,PCDH20,JPH3和KIF1A对CO和DAPK,PAX5β,PAX5α,德尔-1,GATA5,SULF2和CXCL14的海里。
随着这七个基因面板的分类准确率提高到71%的CO(P<0.05)和77%无意义(P<0.001,图1相比,只有协变量)。
因此,随着感光度设定为75%,假阳性率为网管病例对照研究约32%。
图1
ROC曲线对比敏感度和基因甲基化面板的特异性的(A)科罗拉多州(CO)和(B)无意义的研究肺癌病例和对照进行分类。
包括在ROC曲线的协变量包括年龄,性别,吸烟状况和包 ...
OR和95%CI分别计算进一步表征为肺癌的甲基化面板和风险之间的关联。
在风险最大的增长被认为与七个基因面板。
当甲基化的基因的数量被用作一个连续变量(0到7),1.5-和2.0-倍增加的风险为肺癌被认为对于在CO和NM组中的甲基化每一个基因的差异,分别为(表3)。
的或与肺癌的风险为具有三个或更多个甲基化的基因相比,关联<,从7个基因面板3的甲基化基因增加至2.3和5.0的科罗拉多州和NM分别(表3)。
此外,NM病例38%相比,只有3%的控制表现为五个或更多个基因的甲基化相比,那些少于五个基因。
这相当于22.3倍的肺癌的风险增加。
表3
基因甲基化面板和肺癌的风险协会
通过GWAS肺癌的风险识别单核苷酸多态性的评估
全基因组关联研究已经确定了三个染色体区域在15q25,5P15和6p21的为与风险相关的肺癌(19 - 23)。
我们基因型在由CO和NM病例和对照这些染色体区域内的5个SNP,以确定是否整合序列的遗传指标与我们的基因的甲基化变体的面板会提高风险评估。
一个SNP15号染色体上(胆碱受体基因簇),一个内6p21.31(HLA-DQA1),一个内6p21.33(BAT3-MSH5)和两个内5p15.33(CLPTM1L-TERT基因)进行了审问。
所有SNP位点均处于HardyWeinberg平衡(P≥0.05),从每个病例对照研究的对照组。
无单核苷酸多态性与一个显著的风险增加相关,但两个SNP位点(rs1051730Chr15q25和rs3117582Chr6p21)显示保护科罗拉多队列中,一个寻找不同其他队列,并可能是虚假的,由于样本量较小(表4)。
在另外一种遗传指标,是总结从5个基因座中的每个个体的风险等位基因的基因甲基化的面板没有改善的在任一队列肺癌的风险估计(未示出)。
表4
序列协会风险在科罗拉多州和新墨西哥州的病例对照研究肺癌变种
讨论
这项研究已确定,并在两个地理上独立的族群,基因甲基化面板,显示更高的灵敏度和特异性超过我们原来的研究(检测肺癌复制9)。
此外,其中从NM情况下,五个或更多个基因的7个基因面板甲基化赋予一个22倍的增加在肺癌的风险。
在更高的灵敏度和特异性肺癌检测出现在NM队列相比CO是与我们正在进行的假设,即作为癌前负担反射的字段癌变的增加,因此为肺癌的风险,所以没有能力进行检测甲基化的基因的一致痰
(2)。
肺癌是在检测到网管患者为Ⅰ期,而下面的集合中的CO患者痰标本发生3至18个月之间的诊断。
与肺癌的关联,以提高预测精度为我们的基因甲基化面板序列变异无力很可能是与只能在庞大的人口为基础的研究中观察到这些风险等位基因相关的低外显率作用的结果。
七基因面板之间的适度差异的CO和NM使其难以减小12个基因面板用于随后的验证研究。
六个基因,p16基因,MGMT,DAPK,PAX5α,PAX5β和GATA5被确定在我们的初步研究,并已显示工具作为生物标记揭示的遗传决定因素甲基化在呼吸消化道和识别与减少基因启动子甲基化(相关的饮食因素12,13,25)。
小牛-1 ,即抑制肺癌细胞生长的肌动蛋白结合蛋白在体外,表明在区分案件从控制在两个研究中(OR=3.1类似显著差异-3.6)。
该基因的甲基化在非小细胞肺癌,并增加患病率从早期到晚期阶段肿瘤(57%被检测到26)。
CXCL14,而只有在评估网管队列是紧密联系在一起的肺癌以及其丧失功能影响细胞的表达有关周期和促凋亡基因(24)。
总体而言,该基因面板主要是由基因,转录因子(代码GATA5,PAX5α,PAX5β)以及参与调节细胞增殖,粘附和凋亡(基因p16基因,DAPK,DAL-1 ,CXCL14,PCDH20,SULF2;(14 - 17,24,26)。
面临的挑战是相当大的,用于识别非侵入性生物标志物的疾病发展超过30年,并确诊为1年发病率-2%的现任和前任吸烟者45岁到80与超过30包年吸烟史。
这是不可能的,任何单一的生物标志物的平台将实现向前发展的前瞻性筛查作为一种辅助的CT所需的灵敏度和特异性。
在痰基因启动子甲基化与肺癌的特定组织学诊断相关联的事实,证实了其效用作为一种类型的生物标志物用于预测这些类型的肿瘤。
整合我们的基因甲基化面板与其他类的生物标记物,如荧光检测染色体aneusomy的原位痰杂交是一个途径目前所(27)。
基于血清的检测来检测小分子RNA,即本质上是在流通领域更稳定相比,大型的RNA表达的改变,都显露才华作为生物标志物对肺癌的检测,因为是自身抗体组成的小组最近Hanash和同事(开发28 - 30)。
A键血清型标记是要具体的疾病,并展现出足够大的变化的水平相比,用于建立“分级切销”,将生存的变异的血液处理和样品制备(如影响无疾病控制的需要,RNA提取和生成的cDNA)。
鼻腔上皮细胞可能代表组织进行肺癌筛查的另一个原因与一些研究表明损伤的呼吸道领域延伸到鼻子(在检讨31)。
实施验证和在一个大的病例对照研究整合最好的DNA,RNA和蛋白质为基础的生物标志物常见的跨样本(血液,痰液,鼻腔上皮细胞)审问采取多方面的办法可能最终产生的分子标记平台,特异性和灵敏度高够重度吸烟者的前瞻性审查。
平移的相关性
增加生物体液中检测到的分子生物标志物可以识别吸烟者高风险的肺癌和减少假阳性结果增强CT筛查。
我们的团队过去曾经发现痰液中基因甲基化作为一种有前途的生物标志物早期肺癌的检测。
我们扩展了这项工作通过评估31个基因在事件发生肺癌的队列科罗拉多州的巢式病例对照研究,具有前途的基因在第I期肺癌患者从新墨西哥州的地域独立病例对照研究复制。
ROC曲线显示,预测准确度高达77%,与七基因面板。
此外,它至少有五七个基因甲基化在新墨西哥州人群的22倍,增加患肺癌的风险是相关联的。
整合我们的基因甲基化面板与其他类生物标志物可能最终产生的分子标记平台,特异性和敏感性重度吸烟者的前瞻性筛查不够高。
给予支持
这项工作是由研究卓越P50CA58187美国国家癌症研究所专门计划和CA58184,R01CA097356,从MDxHealth的研究经费,以前ONCOMETHYLOME科学公司和新墨西哥州的国家的支持。
参考文献
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- 培养 甲基 表达 水平 早期 肺癌 研究