人类Y染色体DNA单倍型类群.docx
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人类Y染色体DNA单倍型类群
人类Y染色体DNA单倍型类群
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人类Y染色体DNA单倍型类群(HumanY-chromosomeDNAhaplogroups),是利用Y染色体遗传变异特性进行人类学研究的一门科学,主要用于研究人类的“非洲起源论”及以后的种群分布的遗传学证据。
人类有23对46条染色体,其中22对44条为常染色体,另外一对为性染色体,XY组合的为男性,XX组合的为女性。
Y染色体只能父子相传,所以研究Y染色体,可以发现人群在父系关系上的迁徙和发展。
人类Y染色体谱系树是根据Y染色体单倍型类群的不同把全部现代智人分为不同类型,用从A到T的字母作为索引,使用数字和小写字母来进一步细分。
谱系树中的父节点代表的对应基因突变是所有子节点共有的,但反之不然。
Y染色体亚当,在遗传学上是理论上人类父系的最近共同祖先,生活在6-9万年前。
[隐藏]
∙1 树形图
∙2 单倍型类群A和B
∙3 有M168(CT)变异的单倍型类群
∙4 单倍型类群F(G,H&IJK)
∙5 单倍型类群K(M9)
∙6 单倍型类群NO(M214)
∙7 单倍型类群P(M45)
∙8 单倍型类群在欧洲的时间发展
∙9 同见
∙10 参考文献
∙11 外部链接
[编辑]树形图
Y染色体亚当
单倍型类群A0
单倍型类群A1
BT
单倍型类群B
CT
DE
单倍型类群D
单倍型类群E
CF
单倍型类群C
单倍型类群F
单倍型类群F1-F4
单倍型类群G
单倍型类群H
IJK
单倍型类群IJ
单倍型类群I
单倍型类群J
单倍型类群 K
K*
LT
单倍型类群L
单倍型类群T
MNOPS
单倍型类群K1-K4
单倍型类群M
单倍型类群NO
单倍型类群N
单倍型类群O
单倍型类群P
单倍型类群Q
单倍型类群R
单倍型类群S
[编辑]单倍型类群A和B
单倍型类群A是非洲人的子单倍型类群,现代的所有单倍型类群起源点。
BT是单倍型类群A的分支。
它有两个主要谱系,单倍型类群B和CT。
▪单倍型类群A (M91) 分布于非洲,特别分布于科伊桑人, 埃塞俄比亚人(特别分布于贝塔以色列)和尼罗河人
▪BT (M42,M94,M139,M299)约55000年前分离
▪单倍型类群B (M60) 分布于非洲,特别分布于俾格米人和en:
Hadzabe
▪CT(见下)
[编辑]有M168(CT)变异的单倍型类群
主条目:
单倍型类群CT(Y-DNA)
定义突变分离CT(除A和B的所有单倍型类群)为M168和M294。
这些突变早于“走出非洲”的迁移。
DE突变的定义可能发生在非洲东北部,大约65,000年前。
[1] P143突变定义了单倍型类群CF。
可能发生在那时,将现代人类带至亚洲南部海岸。
▪单倍型类群CF (P143) 分布于非洲之外,包括整个欧亚大陆,大洋洲,和美洲
▪单倍型类群C (M130,M216) 分布于亚洲, 大洋洲, 北美
▪单倍型类群C1 (M8,M105,M131) 分布于日本
▪单倍型类群C2 (M38) 分布于印度尼西亚, 新几内亚, 美拉尼西亚, 密克罗尼西亚,和玻利尼西亚
▪
单倍型类群C3分布
单倍型类群C3 (M217,P44) 分布于整个欧亚大陆和北美,特别分布于蒙古人, 哈萨克人, 通古斯人, 古西伯利亚语言,和纳-德内语系人群
▪单倍型类群C4 (M347) 分布于澳大利亚原住民
▪单倍型类群C5 (M356) 分布于印度次大陆, 阿拉伯半岛,和北部中国
▪单倍型类群F (M89,M213)(见下)
▪单倍型类群DE (M1,M145,M203)约65000年前
▪单倍型类群D (M174) 分布于日本, 中国 (特别分布于西藏),安达曼群岛
▪单倍型类群D1 (M15)
▪单倍型类群D2 (M55,M57,M64。
1,M179,P12,P37。
1,P41。
1(M359。
1),12f2。
2)
▪单倍型类群D3 (P47)
▪
单倍型类群E(Y-DNA)分布
单倍型类群E (M40,M96) 主要分布于非洲
▪单倍型类群E1 (P147)
▪单倍型类群E1a (M33,M132) 之前为E1
▪单倍型类群E1b (P177)
▪单倍型类群E1b1 (P2,DYS391p); 之前为E3
▪单倍型类群E1b1a (V38) 分布于非洲,特别分布在尼日尔-刚果语系人群; 之前为E3a
▪单倍型类群E1b1b (M215) 分布于东非,北非,中东,和欧洲(特别分布于地中海地区); 之前为E3b
▪单倍型类群E2 (M75)
[编辑]单倍型类群F(G,H&IJK)
主条目:
单倍型类群F(Y-DNA)
单倍群F和其后代分布
单倍型类群F发现于大约90%的世界人口,但几乎完全在撒哈拉以南非洲地区之外。
IJ的突变对应于45000年前的一个中东或南亚地区的移民浪潮,随后迁移到欧洲(克罗马努)。
单倍型类群G,30000年前起源于中东地区,或更东的地区至巴基斯坦,并迁移至欧洲引发新石器革命。
单倍型类群H可能30000-40000年前起源于印度,并随罗姆人迁移至西方。
单倍型类群K在欧亚大陆,澳洲和南太平洋分布极广。
▪单倍型类群 F* 分布于南部印度, 斯里兰卡, 云南, 朝鲜半岛
▪
单倍型类群G分布
单倍型类群G (M201)约21000年前分离分布于欧亚大陆很多民族;常见于高加索, 伊朗, 安纳托利亚和黎凡特。
几乎分布于所有的欧洲国家,但最常见于加告兹, 罗马尼亚东南部, 希腊, 意大利, 西班牙, 葡萄牙, 蒂罗尔,和波希米亚,在地中海群岛上最尤为常见;在北欧则不常见[2][3] 少量分布于中国西北部和印度, 巴基斯坦, 斯里兰卡, 马来西亚,和北非
▪单倍型类群G1
▪单倍型类群G2
▪单倍型类群G2a
▪单倍型类群G2a1
▪单倍型类群G2a2
▪单倍型类群G2a3
▪单倍型类群G2a3a
▪单倍型类群G2a3b
▪单倍型类群G2a3b1
▪单倍型类群G2b
▪单倍型类群G2c (之前为单倍型类群G5)
▪单倍型类群G2c1
▪
单倍型类群H分布
单倍型类群H (M69) 主要分布于南亚
▪单倍型类群H1
▪单倍型类群H2
▪单倍型类群IJK
▪单倍型类群IJ (P123,P124,P125,P126,P127,P129,P130)约45000年前分离
▪
单倍型类群I分布
单倍型类群I (M170,M258) 分布于欧洲和部分近东地区
▪单倍型类群I1 (M253) 主要分布于北欧
▪单倍型类群I2 (P215) 主要分布于欧洲东南部和撒丁岛 I2B1(m223)主要分布于西部,中部,和北欧。
▪
单倍型类群J分布
单倍型类群J (M304,S6,S34,S35)
▪单倍型类群J* (索科特拉岛之外非常罕见)
▪单倍型类群J1 关联于东北高加索语系人群,分布于美索不达米亚达吉斯坦共和国和闪米特人,黎凡特,阿拉伯半岛, 埃塞俄比亚,和北非
▪单倍型类群J2 (M172) 主要分布在美索不达米亚,安纳托利亚,地中海东部,希腊,巴尔干,意大利,伊朗,和高加索地区
▪单倍型类群K (M9) 遍布欧亚大陆, 大洋洲和美洲
▪LT(见下)
[编辑]单倍型类群K(M9)
单倍型类群L主要分布于南亚。
单倍型类群M则最流行于美拉尼西亚。
NO单倍型类群在35000-40000年前出现在亚洲。
单倍型类群N可能起源于东南亚并扩散到西伯利亚北部和西部,最常见分布于乌拉尔语系人群。
单倍型类群O最常见分布于东亚和东南亚,少量分布于大洋洲, 中亚和南亚。
单倍型类群P引出了群组Q和R,并且很少发现在其未分化的阶段。
很可能起源于中亚或阿尔泰地区。
单倍型类群Q也起源于中亚,向东迁移到北美。
▪单倍型类群K* 分布于美拉尼西亚和澳洲
▪单倍型类群K1(之前为单倍型类群K3) 分布于印度次大陆
▪单倍型类群K2(之前为单倍型类群K4)
▪单倍型类群K3(之前为单倍型类群K6) 分布于美拉尼西亚和玻利尼西亚
▪单倍型类群K4 分布于巴厘岛
▪单倍型类群LT(L298/P326)
▪单倍型类群L (M20) 分布于南亚,中亚,西南亚,地中海
▪
单倍型类群T分布
单倍型类群T (之前被称为单倍型类群K2)(M184,M70,M193,M272) 分布于非洲(主要为亚非语系人群),中东,地中海, 南亚。
极少分布于夏卡, 索马里人, 伊维萨岛, 斯泰尔维奥, 埃塞俄比亚人, 富拉尼人, 埃及人,和阿曼;也很少分布在整个地中海和印度局部
▪单倍型类群MNOPS (rs2033003/M526)
▪单倍型类群M (P256) 分布于新几内亚和美拉尼西亚
▪单倍型类群NO (M214)35000-40000年前分离
▪单倍型类群NO* (极少发现)
▪单倍型类群N (M231) 分布于欧亚大陆北端,特别分布于乌拉尔语系人群
▪单倍型类群O (M175) 分布于东亚,东南亚,南太平洋
▪单倍型类群P (M45)
▪单倍型类群P* (极少发现)
▪单倍型类群Q (MEH2,M242,P36) 分布于西伯利亚和美洲
▪单倍型类群R (M207,M306) 分布于欧洲, 西亚, 中亚和南亚
▪单倍型类群S (M230)(之前被称为单倍型类群K5) 分布于新几内亚高地
[编辑]单倍型类群NO(M214)
单倍型类群O分布
NO单倍型类群在35000-40000年前出现在东亚。
单倍型类群N可能起源于亚洲东部并向北和向西传播于西伯利亚,最常分布于一些乌拉尔语系人群。
单倍型类群O最常分布于东亚和东南亚,在南太平洋、中亚和南亚分布较少。
▪单倍型类群NO (M214)35000-40000年前分离(极少发现)
▪单倍型类群N (M231) 分布于欧亚大陆北端,特别分布于乌拉尔语系人群
▪单倍型类群N1 (LLY22g)
▪单倍型类群O (M175) 分布于东亚,东南亚,南太平洋
▪单倍型类群O1 (MSY2。
2) 分布于中国大陆东部和南部, 台湾,和东南亚,特别分布于南岛民族和壮侗语族人群
▪单倍型类群O2 (P31,M268)
▪单倍型类群O2a (M95) 分布于日本,中国南部,东南亚,和印度次大陆,特别分布于南亚语系人群, 壮侗语族人群, 马来人,和印度尼西亚人
▪单倍型类群O2b (SRY465,M176) 分布于日本, 朝鲜半岛, 满洲和东南亚
▪单倍型类群O3 (M122) 分布于整个东亚,东南亚,和南岛语族包括玻利尼西亚
[编辑]单倍型类群P(M45)
单倍型类群P(M45)有两个分支。
Q-M242和R-M207,都有一个共同的标记M45,至少18 单核苷酸多态性。
单倍型类群Q
单倍型类群Q分布
Q被定义由SNPM242。
认为出现在大约35000-40000年前的中亚。
单倍型类群Q的亚类型和定义变异,根据2008ISOGG树[4]在下文提供。
ss4bp,rs41352448,不出现在ISOGG2008树因为STR。
作为一种新型的Q系(Q5)在印度人中已经被低频率发现[5]
2008ISOGG树
▪Q(M242)
▪Q*
▪Q1(P36。
2)
▪Q1*
▪Q1a(MEH2)
▪Q1a*
▪Q1a1(M120,M265/N14) 少量分布于东干人, 汉族, 哈扎拉人, 日本人, 朝鲜族和藏族[6][7]
▪Q1a2(M25,M143) 中低分布于西南亚, 中亚,和西伯利亚
▪Q1a3(M346)
▪Q1a3* 少量分布于巴基斯坦, 印度和西藏
▪Q1a3a (M3) 典型分布于美洲原住民
▪Q1a3a*
▪Q1a3a1(M19) 分布于一些南美原住民,如en:
Ticuna和瓦尤人[8]
▪Q1a3a2(M194)
▪Q1a3a3(M199,P106,P292)
▪Q1a4(P48)
▪Q1a5(P89)
▪Q1a6(M323) 极少分布于也门犹太人
▪Q1b(M378) 少量分布于哈扎拉族和信德族
单倍型类群R
单倍群R和其后代分布
单倍群R和其后代分布
单倍型类群R的定义由SNPM207。
大部分单倍型类群R表现为R1a和R1b。
R1a可能起源于欧亚大草原,伴随斯基泰人文明和原始印欧语人群的扩张。
主要分布于中亚、南亚和东欧。
R1b可能起源于中亚。
在西欧占主导地位,也稀少分布在亚洲和非洲。
其子群R1b1a2(M269)在现代欧洲人分布最常见,特别在西欧。
▪单倍型类群R1 (M173) 分布于整个欧亚大陆西部
▪单倍型类群R1a (M17) 分布于中亚,南亚和欧洲中部,北部,东部
▪单倍型类群R1b (M343) 分布于西欧, 西亚, 中亚, 北非和北部喀麦隆
▪单倍型类群R2 (M124) 分布于南亚,高加索,中亚和东欧
[编辑]单倍型类群在欧洲的时间发展
单倍型类群
可能年代
可能原居地
高分布人群
K
40,000年前
南亚或西亚
T
30,000年前
西亚
J
30,000年前
中东
R
28,000年前
中亚
E1b1b-M35
26,000年前
东非
I
25,000年前
巴尔干
R1a1
21,000年前
南俄罗斯
R1b
20,000年前
里海周边或中亚
E1b1b-M78
18,000年前
埃及及利比亚
G
17,000年前
高加索
I2
17,000年前
巴尔干
J2
15,000年前
北部美索不达米亚
I2b
13,000年前
中欧
N1c1
12,000年前
西伯利亚
I2a
11,000年前
巴尔干
R1b1b2
10,000年前
高加索西部或北部
J1
10,000年前
阿拉伯半岛
E1b1b-V13
10,000年前
巴尔干
阿尔巴利亚
I2b1
9,000年前
德国
I2a1
8,000年前
萨丁尼亚
I2a2
7,500年前
狄那里克阿尔卑斯山脉
E1b1b-M81
5,500年前
马格里布
柏柏尔人
I1
5,000年前
斯堪的纳维亚
R1b-L21
4,000年前
中部或东欧
R1b-S28
3,500年前
阿尔卑斯山一带
R1b-S21
3,000年前
弗里西亚或中欧
I2b1a
<3,000年前
不列颠
[编辑]同见
▪东亚和东南亚人群的Y染色体DNA单倍型类群
▪en:
Y-chromosomehaplogroupsbypopulations
▪Y-DNAhaplogroupsbyEuropeanpopulations
▪en:
ListofY-DNAsingle-nucleotidepolymorphisms
▪en:
ListofY-STRmarkers
▪en:
HumanmitochondrialDNAhaplogroups
▪单倍型类群
▪en:
Molecularphylogeny
▪基因学
▪en:
GenealogicalDNAtest
▪en:
ConversiontableforYchromosomehaplogroups
[编辑]参考文献
1.^ KarafetTM,MendezFL,MeilermanMB,UnderhillPA,ZeguraSL,HammerMF. NewbinarypolymorphismsreshapeandincreaseresolutionofthehumanYchromosomalhaplogrouptree.GenomeResearch.2008, 18 (5):
830–8. doi:
10.1101/gr.7172008. PMID 18385274. PMC 2336805.
2.^ PassarinoGiuseppe,CavalleriGianpieroL,LinAliceA etal.,Cavalli-SforzaLL,B�rresen-DaleAL,UnderhillPA.DifferentgeneticcomponentsintheNorwegianpopulationrevealedbytheanalysisofmtDNAandYchromosomepolymorphisms.EuropeanJournalofHumanGenetics.2002, 10 (9):
521–529.doi:
10.1038/sj.ejhg.5200834. PMID 12173029.
3.^ KarlssonAndreasO,WallerströmThomas,GötherströmAnders,HolmlundGunilla.Y-chromosomediversityinSweden–Along-timeperspective.EuropeanJournalofHumanGenetics.2006, 14 (8):
963–970. doi:
10.1038/sj.ejhg.5201651. PMID 16724001.
4.^ Y-DNAHaplogroupTree2010.InternationalSocietyofGeneticGenealogy [July2010].
5.^ Sharma,Swarkar;Rai,Ekta;Bhat,AudeshK;Bhanwer,AmarjitS;Bamezaicorresponding,RameshwarNK. AnovelsubgroupQ5ofhumanY-chromosomal单倍型类群Qin印度.BMCEvolBiol.2007, 7:
232. Error:
BadDOIspecified. PMID 18021436.
6.^ SupplementaryTable2:
NRY单倍型类群distributioninHanpopulations,fromonlinesupplementarymaterialfor [1] byBoWenetal。
"GeneticevidencesupportsdemicdiffusionofHanculture," Nature 431,302-305(16September2004)
7.^ Table1:
Y-chromosomehaplotypefrequenciesin49欧亚大陆npopulations,listedaccordingtogeographicregion,from [2] byR。
SpencerWellsetal。
"The欧亚大陆nHeartland:
AcontinentalperspectiveonY-chromosomediversity,"ProceedingsofNationalAcademyofSciencesofUnitedStatesofAmerica(August28,2001)
8.^ "Y-ChromosomeEvidenceforDifferingAncientDemographicHistoriesin美洲," Maria-CatiraBortolinietal。
AmericanJournalofHumanGenetics 73:
524-539,2003
▪^ YChromosomeConsortium
▪^ 2005Y-chromosomePhylogeneticTree,fromFamilyTreeDNA。
com
▪^ ANomenclaturesystemforTreeofHumanY-ChromosomalHaplogroups, Genome。
org
[编辑]外部链接
维基共享资源中相关的多媒体资源:
人类Y染色体DNA单倍型类群
▪UIUCmapsshowingworldwidedistributionofYchromosome和MitochondrialDNAhaplogroups
▪《现代人类学通讯》杂志
▪youku科普视频《人类学、族群、姓氏和Y染色体》
▪ISOGGY-DNAHaplogroupTree
▪ChartofspeedofdifferentYchromosomalSTRmutationrates
▪MapofYHaplogroups
▪AtlasofHumanJourney,fromGenographicProject, NationalGeographic
▪DNAHeritage'sY-haplogroupmap
▪HaplogroupPredictor
▪DNAConsulting'sConversionChartforMaleHaplogroups (PDF)
▪Seminoetal。
(2000) LegacyofPaleolithicHomosapienssapiensinExtantEuropeans:
AYChromosomePerspective Paperthatdefined"Eu"haplogroups
▪WorldfamiliesYHaplogroup&Sub-cladeProjects
▪Kerchner'sYDNAHaplogroupDescriptions,Projec
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- 人类 染色体 DNA 单倍型类群