2R作图Word格式文档下载.docx
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boxplot(X,horizontal=T)##水平放置horizontal=T
3.星相图
星相图绘制stars(x,full=TURE,draw.segment=FALSE,….)
其中,x为数据矩阵或数据框。
full为图形形状,full=T为圆形,full=F为半圆。
draw.segments为分支形状:
draw.segments=T为圆形,draw.segments=F为半圆。
缺省为:
segment=F
stars(X,full=T)
stars(X,full=F)
stars(X,full=T,draw.segments=T)
stars(X,full=F,draw.segments=T)
4.脸谱图
每个指标用人的脸型的某一部分的形状或大小来表达。
这些脸谱之间的差异反映了所对应样品之间的差异特性,使结果更为直观。
脸谱图绘制函数faces(X,nrow.plot,ncol.plot,…)
其中,X为数据矩阵,每列代表一个变量。
nrow,plot为图形显示行数。
ncol,plot为图形显示列数。
library(aplpack)##需先安装aplpack包
faces(X,ncol.plot=7)
faces(X[,2:
8],ncol.plot=7)
faces(X[c(1,9,19,28,29,30),])
二.R软件中的绘图命令
在作图函数中,有两类作图函数。
一类是高水平作图函数:
可产生图形,有坐标轴以及图和坐标的说明文字等;
一类是低水平作图函数:
自身无法生成图形,只能在高水平作图函数产生的图形的基础上,增加新的图形。
1.高水平绘图函数
plot(),pairs(),qqnorm(),qqline(),hist(),contour()等。
(1)plot()函数
plot()可绘制数据的散点图、曲线图等。
A.
plot(x,y),其中x和y是向量,生成x和y的散点图。
x1=c(171,175,159,155,152,158,154,164,168,166,159,164)
x2=c(57,64,41,38,35,44,41,51,57,49,47,46)
B.
plot(x),其中x是一时间序列,生成时间序列图形。
如果x是向量,则产生x关于下标的散点图;
如果x是复向量,则绘出复数的实部与虚部的散点图。
C.
plot(f)
plot(f,y)
其中f是因子,y是数值向量。
第一种格式生成f的直方图,第二种格式生成y关于f水平的箱线图。
利用四种不同配方的材料A1、A2、A3、A4生产出来的元件,测得寿命如下表所示:
绘出四种不同配方材料寿命的箱线图。
y<
-c(1600,1610,1650,1680,1700,1700,1780,1500,1640,
1400,1700,1750,1640,1550,1600,1620,1640,1600,
1740,1800,1510,1520,1530,1570,1640,1600)
f<
-factor(c(rep(1,7),rep(2,5),rep(3,8),rep(4,6)))
plot还可以作很多图,可自行查看帮助文档。
(2)显示多变量数据
pairs(x),当x是矩阵或数据框时,可绘出关于矩阵各列的散点图。
(3)显示图形
其他高水平的绘图函数:
A.qqnorm(),qqline(),绘制QQ散点图。
B.hist(),绘制直方图。
C.dotchart(x),构造数据x的点图。
例如:
R中自带数据VADeaths,是弗吉尼亚州在1940年的人口死亡率。
RuralMaleRuralFemaleUrbanMaleUrbanFemale
50-5411.78.715.48.4
55-5918.111.724.313.6
60-6426.920.337.019.3
65-6941.030.954.635.1
70-7466.054.371.150.0
我们画该数据的点图。
dotchart(VADeaths)
dotchart(t(VADeaths))
D.
image(x,y,z)
countour(x,y,z)
persp(x,y,z)
其中,x、y是数值型向量,z的行数是x的维数,z的列数是y的维数。
Image()绘制三维图形,contour()绘制三维图形的等值线,persp()绘制三维图形的表面曲线。
某山区测得一些地点的高度(单位:
m),如下所示,试做出该山区的地貌图和等值线图。
x<
-seq(0,2800,400);
y<
-seq(0,2400,400)
z<
-scan()
118013201450142014001300700900
1230139015001500140090011001060
12701500120011001350145012001150
13701500120011001550160015501380
14601500155016001550160016001600
14501480150015501510143013001200
1430145014701320128012001080940
Z<
-matrix(z,nrow=8)
image(x,y,Z)
contour(x,y,Z,levels=seq(min(z),max(z),by=80))
persp(x,y,Z)
我们可以看到,图有两个缺点:
一是过于粗糙,其原因是由于数据量过少造成的,如果数据量稍大一些,图形质量将会有很大的改善;
二是三维图的观察角度不理想,这是由于只用到函数中各种参数的缺省值状态,如果改变某些参数的值,图形的观察角度也会随之改变。
persp(x,y,Z,theta=30,phi=45,expand=0.7)
2.高水平绘图中的命令:
在高水平绘图函数中,可以加一些命令,不断完善图的内容,或增加一些有用的说明。
(1)图中的逻辑命令
add=T,表示所绘图在原图上加图,缺省为add=F,即新的图替换原图。
axes=F,表示所绘制图形没有坐标轴,缺省值为axes=T。
(2)数据取对数
log=”x”表示x轴数据取对数,log=”y”表示y轴数据取对数,log=”xy”表示x轴与y轴数据同时取对数。
(3)type命令
type=”p”,散点图(缺省);
type=”l”,实线图;
type=”b”,所有点被实线连接;
type=”o”实线通过所有的点;
type=”h”,绘出点到x轴的竖线;
type=”s”,绘制阶梯形曲线;
type=”n”,不绘制任何点或曲线。
(4)其他图形参数
A.pch,指定绘制点时使用的符号:
B.cex指定符号的大小,cex是一个数值,表示绘图符号相对于默认大小的倍数。
C.lty指定线条类型:
D.lwd指定线条宽度,同cex。
E.col指定绘图颜色,可以写数值,也可以写”red”之类的全称。
函数colors()可以返回左右可用颜色的名称,R中还有其他创建颜色的函数,如rainbow()、heat.colors()、gray()等。
(5)图中的字符串
xlab=””,引号内内容是x轴的名字;
ylab=””,引号内容是y轴的名字;
mean=””,引号内内容是图标题,sub=””,引号内内容是子图的说明。
3.低水平作图函数
有时候高水平作图不能完全达到目的,需要低水平函数予以补充。
低水平函数所作的图形是在高水平作图函数做绘制图形的基础之上,增加新的图形。
低水平作图函数有:
points()、lines()、text()、abline()、lengend()、title()、axis()等。
x=c(171,175,159,155,152,158,154,164,168,166,159,164)
y=c(57,64,41,38,35,44,41,51,57,49,47,46)
(1)加点与线的函数
points(),作用是在已有图上加点,命令points(x,y),其功能相当于plot(x,y)。
lines(),作用是在已有图上加线,命令lines(x,y),其功能相当于plot(x,y,type=”l”)。
(2)在点处加标记
text(),作用是在图上加标记,命令格式为:
text(x,y,labels,…)
其中,x和y是数据向量,labels可以是整数,也可以是字符串,在缺省状态下labels=1:
length(x)。
例如,需要绘制(x,y)的散点图,并将所有点用数字标记,命令为:
plot(x,y);
text(x,y)
(3)在图上加直线
函数abline()可以在图上加直线,使用方法有以下格式:
A.abline(a,b),表示画一条y=bx+a的直线。
B.abline(h=y),表示画出一条过y的水平直线。
C.abline(v=x),表示画出一条过x的垂直直线。
(4)在图上加标记、说明或其他内容
在图上加说明文字、标记或其他内容,用法是:
title(main=””,sub=””,…),主标题在图的顶部,子标题在图的底部。
在坐标轴上加标记、说明或其他内容,用法是:
axis(side,…),side表示边,1、2、3、4分别表示内容放在下、左、上、右。
在图上加图例,用法是:
lengend(location,title,…),location是指定图例位置,title是图例标题。
dose<
-c(20,30,40,45,60)
drugA<
-c(16,20,27,40,60)
drugB<
-c(15,18,25,31,40)
plot(dose,drugA,type="
b"
pch=15,lty=1,col="
red"
ylim=c(0,60),main="
DrugAvs.DrugB"
xlab="
DrugDosage"
ylab="
DrugResponse"
)
lines(dose,drugB,type="
pch=17,lty=2,col="
blue"
abline(h=c(30),lwd=1.5,lty=2,col="
gray"
legend("
topleft"
inset=0.05,title="
DrugType"
c("
A"
"
B"
),lty=c(1,2),pch=c(15,17),col=c("
))
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- 作图