CCA分析步骤.docx
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CCA分析步骤.docx
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CCA分析步骤
1.数据处理
例如现有数据为:
样点
种属
A1
z
d
a
w
r
g
h
y
A2
a
d
c
v
g
h
n
m
j
u
A3
x
c
e
g
n
j
u
i
A4
q
w
s
d
f
b
n
h
j
n
A5
f
d
c
v
b
n
h
y
u
j
k
l
B1
q
a
s
w
r
f
v
b
g
h
j
B2
v
c
x
s
g
b
m
j
B3
b
g
f
x
v
n
B4
g
j
u
i
a
z
x
c
v
B5
b
g
t
y
j
m
i
k
10个样点,A1-B5,A是一年,B是一年。
小写字母代表种属。
将现有数据种属从第一个排到最后一个,在某一样点中,若存在该种属,则填1,若不存在则填0,整理上述数据呈以下状态:
样点
种属
a
b
c
d
e
f
g
h
i
j
k
l
m
n
q
s
u
v
w
x
y
z
A1
1
0
0
1
0
0
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
0
1
1
A2
1
0
1
1
0
0
1
1
0
1
0
0
1
1
0
0
1
1
0
0
0
0
A3
0
0
1
0
1
0
1
0
1
1
0
0
0
1
0
0
1
0
0
1
0
0
A4
0
1
1
1
0
1
0
1
0
1
0
0
0
1
1
1
0
0
1
0
0
0
A5
0
1
1
1
0
1
0
1
0
1
1
1
0
1
0
0
1
1
0
0
1
0
B1
1
1
0
0
0
1
1
1
0
1
0
0
0
0
1
1
0
1
1
0
0
0
B2
0
1
1
0
0
0
1
0
0
1
0
0
1
0
0
1
0
1
0
1
0
0
B3
0
1
0
0
0
1
1
0
0
0
0
0
0
1
0
0
0
1
0
1
0
0
B4
1
0
1
0
0
0
1
0
1
1
0
0
0
0
0
0
1
1
0
1
0
1
B5
0
1
0
0
0
0
1
0
1
1
1
0
1
0
0
0
0
0
0
0
1
0
数据处理成以上状态后,填入excel,得到:
水质指标处理:
样点要与种属表中样点一致,也就是说,两个表中的第一列要保持一致:
将两组数据放在一个excel表的两个sheet中,如图中的:
种属和水质指标。
至此,数据处理结束。
接下来是软件操作:
File
Importproiectfromexcel
Addfiles此处选择刚刚已建立好的excel表格。
此处为CCA.xlsx
Next
此处勾选种属和水质指标,并将下方定义的tables数改成2
Next
出现此页面,先点击种属,然后更改Eachvariableinthetableisa为物种species并为此表命名为species
Next
Next
与种属操作一致,点击水质指标后,将Eachvariableinthetableisa改为
environmentalvariable(此处为默认选项),后为此表命名。
Next
Finish
此处,勾选第二项后
Yes
此处,默认CCA
Next
此处勾选全出项,为蒙特卡洛分析
Next
Finish
Yes
Next
Next
Next
Finish
在Summary选项卡下下滑,SimpleEffects则为蒙特卡洛分析结果。
Graph1则为CCA结果,如下图
如何看图?
水质指标线段的长短代表影响的大小,例如,DO线段最短,影响最小;种属与水质指标夹角代表相关性大小,锐角呈正相关,钝角呈负相关,夹角越小相关性越大,例如a与DO几乎重合,则代表a主要受DO的影响,TN对a也有影响,但不如DO大。
因此数据为胡乱编写的,故规律不明显,真实数据所得结果会好很多,规律也可由其他文献分析得出。
2.样点与水质的PCA
数据导入方法相同,不过只选择水质指标工作簿,表数为1。
全部为默认值,一直向下,直到出现结果:
Graph1则为水质指标与样点的pca分析结果。
结果:
如图中,B1与DO聚在一起,夹角越小说明相关性越大,则B1点主要受DO影响。
还可以看出不同年之间的规律。
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