基因编辑技术的概念和原理PPT推荐.ppt
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基因编辑的研究背景基因编辑的研究背景现代动物分子育种中,分子标记技术能够定位与经现代动物分子育种中,分子标记技术能够定位与经济性状相关的分子标记,锁定基因与性状的对应关济性状相关的分子标记,锁定基因与性状的对应关系,从而快捷可靠地对动物后代进行筛选。
但是,系,从而快捷可靠地对动物后代进行筛选。
但是,利用分子标记技术辅助筛选,改良的程度依然受限利用分子标记技术辅助筛选,改良的程度依然受限于品种自身已有的基因。
于品种自身已有的基因。
所以,利用基因工程技术进行品种改良,可以突破所以,利用基因工程技术进行品种改良,可以突破种源的限制及种间杂交的瓶颈,获取新品种,因此种源的限制及种间杂交的瓶颈,获取新品种,因此分子育种更为本质和直接。
分子育种更为本质和直接。
基因编辑的研究背景基因编辑的研究背景目前,获得突变体的常见方法是利用T-DNA或转座子构建大规模的随机插入突变体库,但是构建覆盖全基因组的饱和突变体库需要的工作量大且耗费的时间长。
而通过定点突变的方法使目的基因完全失活,是一种最直接有效的研究特定基因功能的方法。
基因编辑的研究背景基因编辑的研究背景近年来,随着高特异性及更具操作性的人工核酸酶的出现和技术体系的完善,基因组编辑技术获得了飞速发展,并将靶向基因操作推向高潮,使得定点基因敲除、敲入变得更为简单且高效。
基因编辑的优势基因编辑的优势与传统的以同源重组和胚胎干细胞(embryonicstemcell,ES)技术为基础的基因打靶技术相比,基因编辑新技术保留了可定点修饰的特点,可应用到更多的物种上,效率更高,构建时间更短,成本更低。
基因编辑原理基因编辑原理现代基因组编辑技术的基本原理是相同的,即借助特异性DNA双链断裂(DNAdouble-strandbreaksDSBs)激活细胞天然的修复机制,包括非同源末端连接(NHEJ)和同源重组修复(HDR)两条途径。
基因编辑原理基因编辑原理非同源末端连接非同源末端连接(NHEJNHEJ)是一种低保真度的修复是一种低保真度的修复过程,断裂的过程,断裂的DNADNA修复重连的过程中会发生碱基随修复重连的过程中会发生碱基随机的插入或丢失,造成移码突变使基因失活机的插入或丢失,造成移码突变使基因失活,实现目实现目的基因敲除。
如果一个外源性供体基因序列存在,的基因敲除。
如果一个外源性供体基因序列存在,NHEJNHEJ机制会将其连入双链断裂机制会将其连入双链断裂DSBDSB位点,从而实位点,从而实现定点的基因敲入现定点的基因敲入。
基因编辑原理基因编辑原理同源重组修复(HR)是一种相对高保真度的修复过程,在一个带有同源臂的重组供体存在的情况下,供体中的外源目的基因会通过同源重组过程完整的整合到靶位点,不会出现随机的碱基插入或丢失。
如果在一个基因两侧同时产生DSB,在一个同源供体存在的情况下,可以进行原基因的替换。
基因编辑原理基因编辑原理基因编辑技术的种类基因编辑技术的种类目前主要有3种基因编辑技术,分别为:
nn人工核酸酶介导的锌指核酸酶(zinc-fingernucleases,ZFN)技术;
nn转录激活因子样效应物核酸酶(transcriptionactivator-likeeffectornucleases,TALEN)技术;
nnRNA引导的CRISPR-Cas核酸酶技术(CRISPR-CasRGNs)。
1.ZFN基因组编辑基因组编辑技术技术ZFNZFN技术是第一代基因组编辑技术,其功能的实现是技术是第一代基因组编辑技术,其功能的实现是基于具有独特的基于具有独特的DNADNA序列识别的锌指蛋白发展起来的。
序列识别的锌指蛋白发展起来的。
19861986年年DiakunDiakun等首先在真核生物转录因子家族的等首先在真核生物转录因子家族的DNADNA结合区域发现了结合区域发现了Cys2-His2Cys2-His2锌指模块,到锌指模块,到19961996年,年,KimKim等首次人工连接了锌指蛋白与核酸内切酶。
等首次人工连接了锌指蛋白与核酸内切酶。
20052005年,年,UrnovUrnov等发现一对由等发现一对由44个锌指连接而成的个锌指连接而成的ZFNZFN可识可识别别2424bpbp的特异性序列,由此揭开了的特异性序列,由此揭开了ZFNZFN在基因组编辑在基因组编辑中的应用。
中的应用。
ZFN由锌指蛋白(ZFP)和Fok核酸内切酶组成。
其中,由ZFP构成的DNA识别域能识别特异位点并与之结合,而由Fok构成的切割域能执行剪切功能,两者结合可使靶位点的双链DNA断裂(DSB)。
于是,细胞可以通过同源重组(HR)修复机制和非同源末端连接(NHEJ)修复机制来修复DNA。
HR修复有可能会对靶标位点进行恢复修饰或者插入修饰,而NHEJ修复极易发生插入突变或缺失突变。
两者都可造成移码突变,因此达到基因敲除的目的。
ZFNZFN诱导的基因组编辑技术可应用于很多物种及基诱导的基因组编辑技术可应用于很多物种及基因位点,具有较好的发展潜力。
但是目前有因位点,具有较好的发展潜力。
但是目前有33个方个方面的缺陷制约了该技术的推广面的缺陷制约了该技术的推广:
(1):
(1)以现有的策略设计以现有的策略设计高亲和性的高亲和性的ZFNZFN,需要投入大量的工作和时间需要投入大量的工作和时间;
(2);
(2)在细胞中持续表达在细胞中持续表达ZFNZFN对细胞有毒性对细胞有毒性;
(3);
(3)虽然三联虽然三联体设计具有一定特异性,但仍然存在不同程度的脱体设计具有一定特异性,但仍然存在不同程度的脱靶效应。
靶效应。
2.TALEN基因组编辑技术基因组编辑技术20092009年,研究者在植物病原体黄单胞菌年,研究者在植物病原体黄单胞菌(XanthomonasXanthomonas)中发现一种转录激活子样效应因子,它的蛋白核酸结中发现一种转录激活子样效应因子,它的蛋白核酸结合域的氨基酸序列与其靶位点的核酸序列有较恒定的合域的氨基酸序列与其靶位点的核酸序列有较恒定的对应关系。
随后,对应关系。
随后,TALETALE特异识别特异识别DNADNA序列的特性被序列的特性被用来取代用来取代ZFNZFN技术中的锌指蛋白。
它可设计性更强,技术中的锌指蛋白。
它可设计性更强,不受上下游序列影响,具备比不受上下游序列影响,具备比ZFNZFN更广阔的应用潜力。
更广阔的应用潜力。
TALENs包含两个TALEN蛋白,每个TALEN都是由TALEarray与Fok融合而成.其中一个TALEN靶向正义链上靶标位点,另一个则靶向反义链上的靶标位点.然后Fok形成二聚体,在靶向序列中间的spacer处切割DNA,造成双链DNA断裂,随后细胞启动DNA损伤修复机制.针对不同的TALEN骨架,其最适宜的spacer长度不同,其长度范围一般为1220bp.实验结果表明,TALENs在靶向DNA时,第一个碱基为T时其结合效果更佳。
目前,TALEN已经成功应用于酵母、哺乳动物和植物的位点特异性基因打靶,与锌指核酸酶系统相比有较大的应用优势,但仍然有些问题需要解决,例如:
脱靶效应、TALEN与基因组进行特异结合与染色体位置及邻近序列有关等。
3.CRISPR/Cas9基因组编辑基因组编辑技术技术19871987年,年,IshinoIshino等在等在K12K12大肠杆菌的碱性磷酸酶基因大肠杆菌的碱性磷酸酶基因附近发现串联间隔重复序列,随后发现这种间隔重附近发现串联间隔重复序列,随后发现这种间隔重复序列广泛存在于细菌和古细菌的基因组中。
经过复序列广泛存在于细菌和古细菌的基因组中。
经过几十年的研究,在几十年的研究,在20072007年终于证明这种重复序列与年终于证明这种重复序列与细菌获得性免疫的关系。
细菌获得性免疫的关系。
在这个系统中,只凭借一段在这个系统中,只凭借一段RNARNA便能识别外来基因便能识别外来基因并将其降解的功能蛋白引起了研究者的兴趣。
直到并将其降解的功能蛋白引起了研究者的兴趣。
直到20122012年,年,JinekJinek等第一次在体外系统中等第一次在体外系统中CRISPR/Cas9CRISPR/Cas9为一种可编辑的短为一种可编辑的短RNARNA介导的介导的DNADNA核酸内切酶,标核酸内切酶,标志着志着CRISPR/Cas9CRISPR/Cas9基因组编辑技术成功问世。
基因组编辑技术成功问世。
3.CRISPR/Cas9基因组编辑技术CRISPR/Cas系统由Cas9核酸内切酶与sgRNA构成.转录的sgRNA折叠成特定的三维结构后与Cas9蛋白形成复合体,指导Cas9核酸内切酶识别特定靶标位点,在PAM序列上游处切割DNA造成双链DNA断裂,并启动DNA损伤修复机制.从不同菌种中分离的CRISPR/Cas系统,其CrRNA(或者是人工构建的sgRNA)靶向序列的长度不同,PAM序列也可能不同。
三种不同技术的比较三种不同技术的比较续表续表基因编辑新技术的用途基因编辑新技术的用途nn基因功能研究nn基因治疗nn构建模式动物nn改造和培育新品种1.基因功能研究基因功能研究基因敲除是在活体动物上验证基因功能必不可少的逻辑环节,但是传统的基因敲除方法需要通过复杂的打靶载体构建、ES细胞筛选、嵌合体动物模型选育等一系列步骤,成功率受到多方面因素的限制。
1.基因功能研究基因功能研究即使对于技术比较成熟的实验室,利用传统技术敲除大鼠或小鼠身上的某个基因一般也需要1年以上。
基因编辑新技术则不然,敲除基因高效快速,是研究基因功能的有力工具。
1.基因功能研究基因功能研究ZFN技术已在大鼠、小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥、玉米、烟草等模式生物或经济物种的细胞或胚胎中以及包括诱导多能干细胞(inducedpluripotentstemcells,iPSC)在内的人体外培养细胞系中成功地实现了内源基因的定点突变,其中在果蝇、斑马鱼、大鼠等物种中还获得了可以稳定遗传的突变体。
1.基因功能研究基因功能研究2009年,威斯康辛医学院、SangamoBiosciences、Sigma-Aldrich等多家机构使用ZFN技术,成功培育出首只靶基因敲除的大鼠,而且带有该突变的大鼠所生育的后代同样带有该基因突变。
2.基因治疗基因治疗传统的基因治疗是将正常的基因片段引入细胞中替代有缺陷的基因,但这种方法难以精准控制,可能产生很大的毒副作用。
基因编辑新技术可以精确定位,在靶位点进行修正或进行基因切除,达到基因治疗的目的。
2.基因治疗基因治疗Bacman等人利用TALEN技术清除了来自于病人线粒体内的有病DNA。
这是TALEN首次应用于线粒体基因的编辑,这项研究有望用于治疗母系遗传的线粒体病。
2.基因治疗基因治疗Li等人利用ZFN技术能在染色体上精确定位的优势,通过“剪切”和“粘贴”基因,在实验小鼠体内实现了血友病治疗,避免了传统基因疗法带来的插入诱变风险,首次取得了基因组编辑在基因疗法上的突破。
3.构建模式动物构建模式动物根据人类疾病所构建的动物模型,对研究这些疾病的发生及其治疗有着重要意义。
基因打靶技术是在ES和同源重组技术的基础上发展起来的,模型构建耗时长、成本高,且模式动物的选择受到ES细胞的限制。
基因
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